对于战斗任务的选择，包括截停偷车贼、击败敌人解救市民、抓捕嫌疑人、防止抢劫等，这些简单的任务相对容易对付敌人。抓捕黑猫的任务则需要先找到黑猫，然后通过一场激烈的战斗来征服黑猫，这种任务常常出现在特殊节日，完成后还有机会获得蜘蛛侠套装奖章奖励。当蜘蛛侠跟随一辆汽车到达一个陈旧的公寓时，他在那里遭遇了一位黄头发的男子。
在2099年，蜘蛛侠跃入地面上出现的奇特光洞，径直来到一个控制室，他开始破坏这里的装置。随着世界的不断变化，他爬过通风口，跃入洞穴的中央，并登上二楼的红色仪器以启动机关，结果一辆DNA车出现在他的眼前。蜘蛛侠将车推向中央的核心柱，展开接下来的行动。
蜘蛛侠迅速冲向被困人员，开始采用两种不同的攻击方式：快速攻击和重击(简称为轻攻击和重攻击)。通过鼠标左右键进行操作，他成功击败了敌人并解救了人质。当敌人头顶出现黄色拳头图标时，他会按住q键进行自动闪避。他利用冲击波在不为人察觉的情况下击晕一个胖子，然后按下RB键飞向对方，展开猛烈的进攻。最后，在一个武器箱上按下LB键使用蜘蛛丝撕掉盖子，并进一步攻击第三个武器箱的控制仪表板。
游戏控制方面，按照规定移动，通过点击鼠标左键喷射蜘蛛丝攻击敌人，点击鼠标右键进行连续两次跳跃。当玩家操控蜘蛛侠进行单机游戏时，他需要使用相同的操作方式。在地下室找到一间可以开锁的房间，解救了另一名警卫。这位警卫告诉蜘蛛侠通往金库的密码，随后蜘蛛侠前往小型金库营救最后一个警卫，他也提供了大型金库控制室的密码。最终，蜘蛛侠来到大型金库挑战章鱼男。
在游戏中，按下F键进行网喷操作。若要飞行，玩家可使用shift键的左右键进行左右飞行。当敌人头顶出现晕眩符号时，按下F键使用蜘蛛丝捆住对手。在敌人不备时，可以按下Q键进行刺杀。整体而言，《漫威蜘蛛侠》为玩家带来了经典超级英雄蜘蛛侠的全新体验，让玩家沉浸于这位爬墙者所展现出的动感特技、即兴格斗和蜘蛛丝的发射之中。除了经典元素外，玩家还能体验到一些前所未有的游戏元素。
在游戏中，玩家将漫步于呈现出3D纽约城的游戏场景中，利用蜘蛛侠的超凡能力拯救人类，同时揭示城市的种种秘密。通过按键操作，玩家可以让蜘蛛侠快速弹跳，同时在落地时，按下X键进行跳跃，并通过按下R2键展开摆动。游戏中的Swing操作极为灵活，只需周围有建筑物，蜘蛛侠便可尽情释放蜘蛛丝，没有任何形式的约束。